Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin1P35438 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin1P35438 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms