Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab20P35295 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab20P35295 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab20P35295 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab20P35295 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab20P35295 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab20P35295 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab20P35295 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms