Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5cP35278 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab5cP35278 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab5cP35278 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5cP35278 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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