Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms