Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mmp13P33435 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mmp13P33435 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms