Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou3f3P31361 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou3f3P31361 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms