Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc11P31313 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms