Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnd1P30999 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms