Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tacr1P30548 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms