Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VtnP29788 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VtnP29788 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VtnP29788 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VtnP29788 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VtnP29788 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VtnP29788 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms