Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Celf1P28659 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms