Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BgnP28653 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BgnP28653 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BgnP28653 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BgnP28653 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms