Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Hoxd10P28359 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Hoxd10P28359 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Hoxd10P28359 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Hoxd10P28359 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Hoxd10P28359 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd10P28359 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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