Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apex1P28352 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apex1P28352 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apex1P28352 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms