Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa3P28310 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms