Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LoxP28301 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LoxP28301 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LoxP28301 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LoxP28301 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms