Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjb3P28231 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb3P28231 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms