Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gjb1P28230 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms