Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms