Protein–RNA interactions for Protein: P27699

Crem, cAMP-responsive element modulator, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CremP27699 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CremP27699 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CremP27699 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CremP27699 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CremP27699 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CremP27699 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CremP27699 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CremP27699 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CremP27699 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CremP27699 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CremP27699 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CremP27699 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CremP27699 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CremP27699 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms