Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
U2af2P26369 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
U2af2P26369 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms