Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnna1P26231 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms