Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd11P23813 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms