Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ggta1P23336 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ggta1P23336 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms