Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm3P21107 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm3P21107 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms