Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a2P20490 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms