Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms