Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P20040 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P20040 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P20040 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P20040 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P20040 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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