Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18526 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18526 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18526 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18526 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18526 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18526 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms