Protein–RNA interactions for Protein: P16882

Ghr, Growth hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhrP16882 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GhrP16882 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GhrP16882 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GhrP16882 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GhrP16882 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GhrP16882 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GhrP16882 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GhrP16882 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GhrP16882 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GhrP16882 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GhrP16882 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GhrP16882 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GhrP16882 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GhrP16882 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GhrP16882 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms