Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptan1P16546 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms