Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prph2P15499 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prph2P15499 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prph2P15499 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms