Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd5P13379 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd5P13379 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms