Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd2P13011 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd2P13011 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms