Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PolP11369 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PolP11369 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PolP11369 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PolP11369 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PolP11369 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PolP11369 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PolP11369 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PolP11369 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PolP11369 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PolP11369 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PolP11369 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PolP11369 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PolP11369 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PolP11369 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PolP11369 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolP11369 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms