Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nid1P10493 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nid1P10493 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms