Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igsf6P0C6B7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms