Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb2P0C1T1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb2P0C1T1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms