Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa9P09631 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa9P09631 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms