Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxb7P09024 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb7P09024 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms