Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SparcP07214 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SparcP07214 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SparcP07214 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SparcP07214 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SparcP07214 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SparcP07214 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SparcP07214 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SparcP07214 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SparcP07214 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SparcP07214 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SparcP07214 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SparcP07214 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SparcP07214 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SparcP07214 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SparcP07214 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SparcP07214 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SparcP07214 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SparcP07214 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SparcP07214 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SparcP07214 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms