Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ifna7P06799 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna7P06799 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms