Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06344 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06344 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06344 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06344 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06344 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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P06344 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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P06344 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06344 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06344 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06344 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms