Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06321 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06321 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06321 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06321 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06321 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06321 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms