Protein–RNA interactions for Protein: P04946

Ig kappa chain V-V region NQ5-89.4, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04946 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04946 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04946 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04946 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04946 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04946 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04946 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04946 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04946 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04946 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04946 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04946 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms