Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc4a1P04919 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc4a1P04919 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms