Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GzmbP04187 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms