Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-K1P01901 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-K1P01901 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms