Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01798 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01798 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01798 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01798 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01798 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01798 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01798 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01798 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01798 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01798 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01798 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01798 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01798 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms