Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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P01649 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01649 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01649 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01649 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01649 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01649 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01649 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01649 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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P01649 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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P01649 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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P01649 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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P01649 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01649 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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P01649 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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P01649 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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P01649 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01649 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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P01649 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01649 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01649 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms